islasgeci/misctools

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By Conservación de Islas

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Data science
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islasgeci/misctools repository overview

🛠️ Herramientas Misceláneas

MiscTools es un conjunto de herramientas pequeñas y prototipos del equipo de Ciencia de Datos de GECI.

🧰 Lista de herramientas

HerramientaDescripción
geci-checkanalysesUsa jsonschema para verificar la estructura de analyses.json
geci-tdp2xlsTransforma tabular data packages a Excel
geci-validateVerifica que un data package cumple con el protocolo de GECI
📋 Prerequisitos

Estas instrucciones son para instalar y configurar MiscTools en Ubuntu 20.04 (Focal Fossa).

Instala Docker, Git y Make.

sudo apt update && sudo apt install --yes docker.io git make

Para correr Docker sin sudo (y evitar el mensaje: Got permission denied...) agrega tu usuario al grupo docker:

sudo usermod -aG docker $USER

Reinicia tu máquina para que el sistema re-evalue tu pertenencia al grupo docker.

Verifica que puedes correr Docker sin sudo:

docker run hello-world

🏗️ Instalación

git clone https://github.com/IslasGECI/misctools.git
cd misctools
make install
cd ..
sudo rm --recursive misctools

✅ Verifica la instalación

Ejecuta:

geci-validate --version

Si tu instalación es correcta obtendrás un resultado similar a:

geci-validate v0.1.0+wxyz

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sha256:f89ff1c1a

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docker pull islasgeci/misctools:2cc7

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